Elementi trasponibili in genomi di artropodi con strategie riproduttive non-canoniche.

Scavariello, Claudia (2016) Elementi trasponibili in genomi di artropodi con strategie riproduttive non-canoniche., [Dissertation thesis], Alma Mater Studiorum Università di Bologna. Dottorato di ricerca in Biodiversità ed evoluzione, 28 Ciclo. DOI 10.6092/unibo/amsdottorato/7514.
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Abstract

Gli elementi trasponibili (TEs) sono componenti universali dei genomi di tutti gli esseri viventi. L'attività ed il movimento degli TEs hanno importanti effetti sul genoma ospite e per questo sono considerati dei fattori importanti nell'evoluzione del genoma. Le relazioni che intercorrono tra TEs e il loro genoma ospite sono ancora ampiamente dibattute. Hickey già nel 1982 suggerì che queste relazioni potevano essere influenzate dalla modalità di riproduzione del genoma ospite. Organismi bisessuali, attraverso i meccanismi propri della meiosi, riuscirebbero a contrastare la proliferazione degli TEs, al contrario negli organismi unisessuali, proprio a causa della mancanza di questi meccanismi, gli TEs tendono a proliferare ed accumulare all'interno del genoma. Al fine di valutare queste ipotesi, ho isolato e caratterizzato gli TEs in organismi con strategie riproduttive non canoniche. Ho condotto le mie analisi in due organismi: gli insetti stecco del genere Bacillus e nel fossile vivente Triops cancriformis. Entrambi presentano strategie riproduttive che vanno dal gonocorismo alla partenogenesi, rendendoli un eccellente modello per lo studio e la caratterizzazione degli TEs. Nel genere Bacillus mi sono focalizzata sullo studio del retrotransposone non-LTR R2. Ho isolato e caratterizzato sette elementi R2 completi; sia in specie gonocoriche che partenogenetiche. Ho trovato un elemento R2 degenerato presente nel genoma di B. rossius da almeno 5 milioni di anni. In oltre, le mie analisi suggeriscono per la prima volta che anche gli elementi R2 possono trasferirsi attraverso eventi di trasferimento orizzontale. I miei dati mostrano una panoramica della composizione di TEs nel genoma di una popolazione partenogenetica di Triops cancriformis. Dalle mie analisi si evince che il 20% della library di triops è composta da TEs.

Abstract
Tipologia del documento
Tesi di dottorato
Autore
Scavariello, Claudia
Supervisore
Co-supervisore
Dottorato di ricerca
Scuola di dottorato
Scienze biologiche, biomediche e biotecnologiche
Ciclo
28
Coordinatore
Settore disciplinare
Settore concorsuale
Parole chiave
Transposable elements; reproductive strategies; parthenogenesis; stick insect; tadpole shrimp; genome evolution; R2 non-LTR retrotransposon
URN:NBN
DOI
10.6092/unibo/amsdottorato/7514
Data di discussione
17 Maggio 2016
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