Inter-individual variability of the gut microbiota in human disease: implications for precision medicine

Il microbiota intestinale (GM) è un ecosistema altamente dinamico, essenziale per la regolazione immunitaria e l'omeostasi dell'ospite. Questa tesi caratterizza la struttura e la dinamica temporale del GM in diversi contesti clinici per identificare firme microbiche utili alla diagnosi precoce, alla stratificazione del rischio e alla terapia mirata. La prima parte si concentra sulla malattia diverticolare (SUDD), dimostrando che il GM dei pazienti si stratifica in base alla gravità del dolore addominale (punteggi VAS) e alla classificazione endoscopica DICA. Un intervento con butirrato di sodio a rilascio colonico ha ridotto significativamente il dolore e ripristinato l'alfa-diversità microbica, evidenziando il potenziale delle strategie terapeutiche mirate al microbiota. Nelle infezioni urinarie pediatriche (UTI), la ricerca ha rivelato che la profilassi antibiotica continua (CAP) induce una maturazione asincrona del GM verso un profilo di tipo adulto, bypassando stadi critici dello sviluppo e ampliando il resistoma intestinale. Riguardo all'asse intestino-cervello, lo studio evidenzia come l'umore materno e l'adesione alla dieta mediterranea in gravidanza influenzino il microbiota neonatale e la salute del bambino a due anni. Inoltre, in pazienti con Parkinson, l'irrigazione trans-anale (TAI) migliora la stipsi cronica inducendo cambiamenti misurabili nel GM. Infine, un trial sull'obesità grave mostra che la dieta chetogenica (VLCKD) promuove una perdita di peso e un rimodellamento microbico superiori rispetto alla dieta mediterranea. Dati preliminari sul carcinoma pancreatico (PDAC) hanno permesso di identificare biomarcatori di transizione in individui ad alto rischio prima dell'esordio della malattia. In sintesi, la tesi identifica la disbiosi come un fattore modificabile e sottolinea il ruolo della medicina di precisione nello sviluppo di interventi preventivi e terapeutici personalizzati.